公司在新三板挂牌一般操作流程如下： 1.前期准备工作 (1)拟挂牌公司选择具备新三板推荐资质的证券公司为主办券商，签订合作协议。 (2)与主办券商研究确定挂牌方案，股份有限公司改制方案。 (3)举行股东会通过新三板挂牌和股改方案决议。 (4)在主办券商指导下制作挂牌申请文件。 2.中介机构进场制作申报文件 中介机构由主办券商牵头，偕同律师事务所、审计师事务所(需要资产评估的还要聘请具备证券业务资质的资产评估事务所)进场，对企业主体资格、经营业务、财务会计、产权关系、法律事务等展开尽职调查。挂牌所有文件均需依据尽职调查资料，决定挂牌审核快慢，因此企业一定要全力配合。在尽职调查基础上，分头制作申报文件。 (1)律师制作《法律意见书》。《法律意见书》是由具备证券业务资质等条件的律师事务所出具，就新三板挂牌条件涉及的公司法律主体地位、产权法律关系、股权设置与公司治理、申请挂牌的法定程序以及法务问题等，根据同家法律法规和尽调资料所做的法律陈述文件。《法律意见书》可证明公司挂牌和股权交易的合法性。 (2)主办券商制作《公开转让说明书》。《公开转让说明书》是申报挂牌和挂牌后交易的核心文件，其地位和作用类似主板IPO招股说明书。为此，股转系统2013年出台《公开转让说明书内容与格式指引》，要求对挂牌公司基本面、经营业务、财务状况、治理结构等凡是对投资者投资决策有重大影响的信息，均应充分披露。《公开转让说明书》一般在中介机构进行尽职调查，律师出具法律意见书》之后，由主办券商制作完成。 3.主办券商内部审核 主办券商内部审核简称“内核”，是根据持续督导责任，对公司挂牌条件全面审查，相当于申报股转系统前的预审。合规内核要点包括挂牌公司主体资格、注册资本出资情况、公司设立与变更、股权设置和构成、控股股东与实际控制人、董监高及核心员工、公司规范运作、依法经营与环保、纳税等情况。 4.报送申请文件 按照股转系统规定的新三板挂牌申请文件内容与格式指引，申请文件包括： 第一部分 公开披露文件 ①公开转让说明书； ②财务报表及审计报告； ③法律意见书； ④公司章程； ⑤主办券商推荐报告； ⑥股票发行情况报告书。 第二部分 不要求披露的文件 ①向全国股份转让系统公司提交的申请股票在全国股份转让系统挂牌及股票发行的报告； ②有关股票在全国股份转让系统挂牌及股票发行（如有）的董事会决议； ③有关股票在全国股份转让系统挂牌及股票发行（如有）的股东大会决议； ④企业法人营业执照; ⑤股东名册及股东身份证明文件； ⑥董事、监事、高级管理人员名单及持股情况； ⑦申请挂牌公司设立时和最近两年及一期的资产评估报告； ⑧申请挂牌公司最近两年原始财务报表与申报财务报表存在差异时，需提供差异比较表； ⑨申请挂牌公司全体董事、监事和高级管理人员签署的《声明及承诺书》； ⑩主办券商与申请挂牌公司签订的推荐挂牌并持续督导协议； ?尽职调查报告； ?尽职调查工作文件（包括尽职调查工作底稿目录、相关工作记录和经归纳整理后的尽职调查工作表，有关税收优惠、财政补贴的文件，历次验资报告，对持续经营有重大影响的业务合同等）； ?内核意见（包括内核机构成员审核工作底稿，内核会议记录，对内核会议反馈意见的回复，内核专员对内核会议落实情况的补充审核意 见等）； ?主办券商推荐挂牌内部核查表及主办券商对申请挂牌公司风险评估表； ?主办券商自律说明书； ?主办券商业务备案函复印件（加盖机构公章并说明用途）及项目小组成员任职资格说明文件。 第三部分 其他相关文件 ①申请挂牌公司全体董事、主办券商及相关中介机构对申请文件真实性、准确性和完整性的承诺书； ②相关中介机构对纳入公开转让说明书等文件中由其出具的专业报告或意见无异议的函； ③申请挂牌公司、主办券商对电子文件与书面文件保持一致的声明； ④律师、注册会计师及所在机构的相关执业证书复印件（加盖机构公章并说明用途）； ⑤国有资产管理部门出具的国有股权设置批复文件及商务部出具的外资股确认文件； ⑥证券简称及证券代码申请书。 5.全国股份转让系统意见反馈 申请文件通过股转系统服务窗口进行报送。股转系统按规定目录和格式对申请材料进行形式审查。申请材料符合齐备性、完整性条件的，出具申请文件接收单确认受理。申请文件不符合形式要件规定，需要企业补充披露、解释说明，或需要主办券商进一步核查落实的问题，书面提出反馈意见，通知企业及主办券商补正。企业应在三十个工作日内提交反馈回复意见。 6.股转系统出具审查意见 申请材料和反馈回复意见审查完毕后，股转系统出具同意或不同意挂牌或股票发行的审查意见，送达企业、主办券商及相关单位。 7.登记挂牌阶段 挂牌审核通过后，主办券商协助企业完成在股转系统登记挂牌工作： ①分配股票代码； ②办理股份登记存管； ③公司挂牌敲钟。 8.全国股份转让系统公司备案确认 新三板实行备案制，在完成第五个、第六个流程后，全国股份转让系统公司就会正式给出确认，是同意在新三板挂牌还是不同意挂牌。当然，这个还需要律师、中介机构以及券商的全力配合才能得到理想中的结果， 但并不代表一定可以得到肯定的答案。